萬世特攻平和祈念館為展示太平洋戰爭期間，參與陸軍沖繩航空作戰之特別攻擊隊員，以及飛行第66戰隊員、飛行第55戰隊員、第19航空通信連隊員、神風特別攻擊隊海軍第一正統隊員之遺影、遺書與遺物之設施。透過史實的呈現，使人們認識並深切感受「和平的可貴與重要性」。
藉由遺書與影像資料等，讓不同世代的人們得以認識並深切體會「和平的可貴與重要性」，將這份「祈願和平的心意」傳達至每一位來訪者心中。
外觀設計
建築外觀仿造少年飛行士兵所嚮往的九五式一型雙翼練習機（俗稱「紅蜻蜓」）。屋頂的垂直尾翼造，象徵人們於晨昏時分雙手合十、向佛祈禱的姿態。
標誌Logo設計理念
標誌融合了屋頂「合掌祈禱和平」的意象與飛機翱翔天際的畫面。下方延展的曲線象徵「和平向未來無限延伸」，蘊含對和平的期盼。
萬世(Yorozuyo)之碑
「萬世」為舊地名，讀作「Yorozuyo」，並加上助詞「ni」，引用於《日本書紀》，寓意為「千年萬年、和平永存」。
飛行隊員青銅像臉部皆面向萬世地區的東方。其一是因為隊員在出征前曾與戰友、家人約定在「櫻花盛開的九段相會」（九段：靖國神社所在地）。其二，象徵來自日本各地的201位戰歿者。由萬世向東望去，正是北海道、本州、四國與九州的方向，願戰歿的隊員們能看見父母與兄弟姊妹所在的遠鄉。右側副碑刻有特攻振武隊121名；左側副碑刻有飛行第66戰隊72名、飛行第55戰隊6名、第19航空通信連隊1名、海軍第一正統隊1名，合計201位英靈之姓名與戰歿日期。
慰靈碑祭典
每年4月第2個星期日舉行（※若逢每4年一次之地方選舉，則改於第4週星期日舉行）
「萬世之碑」前，全國各地遺族及相關人士獻花，並與來賓及一般出席者一同追悼，肅穆莊嚴地舉行慰靈祭典。
殉職者之碑
此碑建立於平成24年（西元2012年）。昭和20年（西元1945年）3月29日，金峰町國防婦人部員於勤勞奉獻作業時，因突如其來的空襲，避難至無線電塔附近的新川防空壕。直擊防空壕的炸彈，造成包含幼童在內共19人罹難。為撫慰與特攻隊員、飛行隊員、戰歿者同樣為國殉職的國防婦人部員之靈而立。
苗村七郎先生顯彰碑
此碑為表彰苗村七郎先生而建立。苗村先生曾以飛行第66戰隊少尉身份參加沖繩航空作戰。戰後，他自費走遍全國，蒐集由遺族託付的遺物與遺書，並為萬世特攻平和祈念館的創立奠定基礎。
